《难经》第六十六难提出了十二经脉的原穴名称，并论述了五脏以俞为原的道理，以及三焦之气所通行的穴位作为原穴的原因。
一、《难经》第六十六难原文
六十六难曰：经言肺之原出于太渊，心之原出于太陵[1，肝之原出于太冲，脾之原出于太白，肾之原出于太溪，少阴之原出于兑骨[2]，胆之原出于丘墟，胃之原出于冲阳，三焦之原出于阳池，膀胱之原出于京骨，大肠之原出于合谷，小肠之原出于腕骨。
十二经皆以俞为原者，何也？
然：五藏俞者，三焦之所行，气之所留止也。三焦所行之俞为原者，何也？
然：脐下肾间动气者，人之生命也，十二经之根本也，故名曰原。三焦者，原气之别使(3)也，主通行三气(4)，经历于五藏六府。原者，三焦之尊号也，故所止辄为原。五藏六府之有病者，取其原也。
[注释][1]太陵：即大陵，经穴的名称，位于掌面腕横纹中点，掌长肌腱与桡侧腕屈肌腱之间凹陷处。[2]兑骨：兑与“锐”通，兑骨此处指神门穴，位于掌后腕横纹尺侧端凹陷中。[3]原气之别使：别使，另外的使者。这里指三焦能通行元气，是元气另外的通道。[4]三气：指宗气、卫气、营气。
二、《难经》第六十六难译文
第六十六问：医经上说，手太阴肺经的原穴是太渊，心(指手厥阴心包经)的原穴是太陵，足厥阴肝经的原穴是太冲，足太阴脾经的原穴是太白，足少阴肾经的原穴是太溪，手少阴心经的原穴是兑骨，足少阳胆经的原穴在丘墟，足阳明胃经的原穴在冲阳，手少阳三焦经的原穴在阳池，足太阳膀胱经的原穴在京骨，手阳明大肠经的原穴在合谷，手太阳小肠经的原穴在腕骨。
问：十二经脉都把输穴作为原穴，这是什么原因呢？
答：十二经脉中五脏各经脉的输穴，因为有三焦之气的通行和停留，所以才把输穴作为原穴。
问：把三焦之气所通行的输穴作为原穴，这是什么原因呢？答：人脐下肾间的动气，是维持生命的原动力，是十二经脉的根本，所以叫做原气。三焦，是原气运送到全身各处的通道，有贯通运行卫气、营气、宗气的功能，能使原气循行于五脏六腑。原，是对三焦的尊称，因此三焦之气所留止的穴位，则称为原穴。五脏六腑如果有了疾病，都可以取原穴加以治疗。
三、《难经》第六十六难解析
1.本难所提出的十二原穴，与《灵枢·九针十二原》所述不同。《灵枢·九针十二原》所指原穴为五脏经脉左右的两原穴，计为10个原穴，再加“膏之原，鸠尾一”，“肓之原，脖腴(yāng)一”，共为12原，并没有六腑的原穴。本难所提的十二原除增加的手少阴之原兑骨外，均与《灵枢·本输》相同。到了晋代，皇甫谧才在《甲乙经》中补充了心经的原穴神门，至此，十二经脉的井、荥、输、经、合、原才完备。目前，临床上应用的，即本于《甲乙经》。具体名称，可参68难讨论中的附表。
2.原穴十二经脉皆有，五脏以输穴作为原穴，而六腑则有输穴和原穴，分别为两个穴位。所以文中在回答“十二经皆以俞为原”的提问时，只说五脏以输为原，并没有提到六腑，这是应该注意的。
3.原穴为三焦原气通行之处，为人之生命所系，是十二经脉的根本，其分布手不过腕，足不过踝，处于神气、真气所行之地，以及十二经脉脉气盛大的输穴处或其后，因此原穴在诸腧穴中有着十分重要的临床价值。有人统计，在《徐氏针灸大全》《针灸大成》《疗病选穴》等7部针灸医籍中，所收录的2468首针灸处方中，原穴处方占43%，其中《针灸大成》杨氏治症总要的151首处方中，原穴处方竟占52%。这说明，原穴在临床上的使用率较高，治疗范围广，疗效高。古今大量的临床文献都表明，很多疾病，用它法不效者，改用原穴每能收到满意疗效。因此，五脏六腑的疾病，一般可首选原穴进行调治，以通达原气而达到扶正祛邪的目的。
4.近现代对原穴的研究表明：①原穴能反映整个机体的生理病理状态。有人测定，当人体阳气旺盛时，原穴的导电量升高，反之则下降，当原穴导电量多数为0时，则病危。同时在反映机体病变方面，原穴比郗穴、募穴、俞穴更敏感。②各原穴为本经的代表点。有人测定，十二经经穴导电量的总平均值与各经原穴相近，原穴较易诱发本经的循经传感。③原穴与相关脏腑具有特异性联系。实验证明，针刺心之原–神门，肝之原–太冲，引起的脉搏图的变化分别在左寸部(心)、左关部(肝)较大，并具有统计学意义。④原穴具有双向调节性。当人体状态为虚，则原穴能补;人体状态为实，则原穴能泻。